Свой профессиональный путь Гор начал в 1992 году в «ДиалогБанке». В «Тройку Диалог» перешел в 1993 году и стоял у истоков создания компании. С февраля по сентябрь 2013 года Гор Нахапетян занимал позицию вице-президента Сбербанка. В рамках данной должности он курировал блок HR, в числе ключевых задач которого – формирование и развитие корпоративной культуры, усовершенствование и развитие системы мотивации сотрудников, создание корпоративного университета, построение системы эффективных коммуникаций внутри организации. С 2006 года является членом Координационного совета Московской школы управления СКОЛКОВО, а также председателем Комитета по кадрам.